На протяжении многих лет данная служба является неотъемлемой частью единого процесса оперативно-служебной деятельности пенитенциарного ведомства. В современных экономических условиях по защите финансовых и имущественных интересов УИС, контрольно-ревизионное отделение осуществляет контроль за рациональным и эффективным расходованием государственных средств, и пресекает факты их нецелевого использования.